实验室应有管道排气系统，风向从“洁净区”到“污染区”。排出的空气不再循环至建筑物内的任何其他区域。外部排气口要远离有人区、进风口，否则需经过HEPA过滤。实验人员必须证实进入实验室的风向是正确的。建议在实验室的入口处设置可视的监视装置，表明和证实进风的风向。要考虑安装HVAC控制系统，防止实验室持续正向增压。同时应安装声音报警装置，警告实验人员HVAC系统出了问题。并且至少每年要测试HEPA系统，确保工作正常。
当操作不能在生物安全柜中进行时，应使用个人防护设施如口罩、面罩等防范装备。而实验室中的其它配套仪器也以配有安全罩，密闭设备或其它物理防范设施为宜。如带安全罩或密封转头的离心机，带安全罩的生物反应系统等，详见本文后面的相关描述。处理实验垃圾的设施放在实验室内（即高压锅、化学消毒剂、焚烧炉和其他可行的消毒方法）。垃圾运出实验室时应当密封，不应通过公共通道运送。
根据实验室的用途，它可以大致分为：准备室（或预处理室）、分析室、仪器室、天平室、微生物室（或洁净室）、储藏室等，在布局设计中，在满足实验室不同功能需求的同时，要考虑实验工作的过程，做出合理的布局，实验室应该有足够的空间来满足每个实验的需要。每种类型的分析都应该有一个单独的区域，区域之间有物理隔离。实验室的布局和仪器的购买应符合实际检查任务。实验室应根据需要远离灰尘。
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