当操作不能在生物安全柜中进行时，应使用个人防护设施如口罩、面罩等防范装备。而实验室中的其它配套仪器也以配有安全罩，密闭设备或其它物理防范设施为宜。如带安全罩或密封转头的离心机，带安全罩的生物反应系统等，详见本文后面的相关描述。处理实验垃圾的设施放在实验室内（即高压锅、化学消毒剂、焚烧炉和其他可行的消毒方法）。垃圾运出实验室时应当密封，不应通过公共通道运送。
普通洁净实验室中进行的实验要求环境对实验本身不造成不良影响，因此实验室内不设防护设施，而洁净度必须达到实验要求，所以要进行一下实验室消毒。生物安全实验室是具有一级防护设施的，可实现二级防护的生物实验室。室内设有试剂柜、存放器具或材料的专柜、实验台、电炉、冰箱和上下水道、电源等。灭菌室主要用于培养基的灭菌和各种器具的灭菌，室内应备有高压蒸汽灭菌器、烘箱等灭菌设备及设施。
设备存放室主要是存放一些现场采样及部分现场监测设备。比如粉尘采样器、气体采样器、中流量采样仪、烟气分析仪、林格曼测烟望远镜、积分声级计等采样及现场检测设备。设备存放室应保持通风良好，根据设备的存放要求控制一定的温湿度。信息管理可以实时反映实验室的实际情况。主管部门可以随时查询仪器设备的使用情况。实验室人员可以随时检查实验课程情况，以便及时发现问题、解决问题。
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