实验室装修是一项复杂的系统工程，它不只是简单的水电、油漆、地面和吊顶，更要考虑实验室的科学性、安全性和功能性。因为实验室的特殊性，实验室装修工作要综合考虑实验室整体规划、合理布局和平面设计，多工种、多工序之间需要无缝衔接。通风方式有两种：强力排风和全室换风。 强力排风可用通风柜(橱)，主要用于干法炭化、湿法消化、以及使用有毒有害气体和一些产生有毒有害气体的试验。
实验室设计前应根据该实验流程来确定仪器的种类、数量、规格型号、外形尺寸、电压功率等参数以及摆放位置，设计师针对性的做出仪器电源、给排水、供气、纯净水以及排风管道接口的设计。因为用过的器具已被微生物污染。因此，在条件允许的情况下设置洗涤室。房间里应该有一个加热器。、蒸笼，洗衣盆、桶等，还应有各种瓶刷、去污粉、肥皂、洗衣粉等。
微生物实验室应选择在清洁安静的场所，远离生活区，锅炉与交通要道，微生物实验室应选择在光线充足，通风良好的场所，要与实验室其他区域，如饮水间、卫生间等区域有一定的距离。样品储藏分为常温和低温两种条件。常温环境宜采用储物架存放；低温环境宜采用冰箱或者冰柜储藏样品。样品储藏室要求通风良好，避光，一定的湿度。
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