实验室设计前应根据该实验流程来确定仪器的种类、数量、规格型号、外形尺寸、电压功率等参数以及摆放位置，设计师针对性的做出仪器电源、给排水、供气、纯净水以及排风管道接口的设计。因为用过的器具已被微生物污染。因此，在条件允许的情况下设置洗涤室。房间里应该有一个加热器。、蒸笼，洗衣盆、桶等，还应有各种瓶刷、去污粉、肥皂、洗衣粉等。
实验室应该有足够的空间来满足每个实验的需要。每种类型的分析都应该有一个单独的区域，区域之间有物理隔离。实验室的布局和仪器的购买应符合实际检查任务。智能化实验室管理系统应根据数字校园的规划要求采用统一的信息标准和基础设施，与其他信息系统共享和互联，实现实时交换。信息资源是利用信息技术将传统教学和研究素材转化为易于传播的信息资源、有助于理解和运用数字化资源。
微生物实验室应选择在清洁安静的场所，远离生活区，锅炉与交通要道，微生物实验室应选择在光线充足，通风良好的场所，要与实验室其他区域，如饮水间、卫生间等区域有一定的距离。样品储藏分为常温和低温两种条件。常温环境宜采用储物架存放；低温环境宜采用冰箱或者冰柜储藏样品。样品储藏室要求通风良好，避光，一定的湿度。
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