实验室应设立单独的给水、排水系统，避免受到污染或者污染周围环境。实验室内的通风、采光、温度、湿度、清洁度等均应达到实验室的环境要求，实验室也要给人留下整洁、美观、舒适的观感。所有实验用的桌子台要面采用先进环保材料制作，保证耐酸、耐碱和耐腐蚀性，同时要做到防火、防水、易于清洁。实验室检验设备是实验室的珍贵资源，也是进行检测的重要工具，检测检验数据科学是否准确的重要保障。
实验室应有管道排气系统，风向从“洁净区”到“污染区”。排出的空气不再循环至建筑物内的任何其他区域。外部排气口要远离有人区、进风口，否则需经过HEPA过滤。实验人员必须证实进入实验室的风向是正确的。建议在实验室的入口处设置可视的监视装置，表明和证实进风的风向。要考虑安装HVAC控制系统，防止实验室持续正向增压。同时应安装声音报警装置，警告实验人员HVAC系统出了问题。并且至少每年要测试HEPA系统，确保工作正常。
当操作不能在生物安全柜中进行时，应使用个人防护设施如口罩、面罩等防范装备。而实验室中的其它配套仪器也以配有安全罩，密闭设备或其它物理防范设施为宜。如带安全罩或密封转头的离心机，带安全罩的生物反应系统等，详见本文后面的相关描述。处理实验垃圾的设施放在实验室内（即高压锅、化学消毒剂、焚烧炉和其他可行的消毒方法）。垃圾运出实验室时应当密封，不应通过公共通道运送。
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