实验室应有管道排气系统，风向从“洁净区”到“污染区”。排出的空气不再循环至建筑物内的任何其他区域。外部排气口要远离有人区、进风口，否则需经过HEPA过滤。实验人员必须证实进入实验室的风向是正确的。建议在实验室的入口处设置可视的监视装置，表明和证实进风的风向。要考虑安装HVAC控制系统，防止实验室持续正向增压。同时应安装声音报警装置，警告实验人员HVAC系统出了问题。并且至少每年要测试HEPA系统，确保工作正常。
室内设有试剂柜、存放器具或材料的专柜、实验台、电炉、冰箱和上下水道、电源等。灭菌室主要用于培养基的灭菌和各种器具的灭菌，室内应备有高压蒸汽灭菌器、烘箱等灭菌设备及设施。根据环境实验室的测试项目，标准方法及相关的建设规范，一般的环境测试实验室设计规划会有以下功能间：样品存放室宜设置在阴凉干燥处。样品储藏室要求通风良好，避光，一定的湿度。
信息管理可以通过实验室信息自动生成统计报告随时更新，使实验室管理人员免于繁重信息统计工作，从而投入到建设实验平台、资源建设工作中去。同时简化了行政程序，缩短了处理周期，提高了管理工作的效率。智能实验室的建设不仅是管理工具的变革，也是管理模式的。大型精密仪器室按仪器的类型，一般分为光谱室、气相色谱室和液相色谱室。安装大型仪器的实验室，应安装专门的制冷设备，以保证室温和湿度的控制。色谱室内要有良好的通风，宜配备万向排气罩。
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